崇祯二年九月，大明五军都督府多次上书朱由检，言京营弊，奏陈京营多年来武备松懈，战斗力严重不足，已不足以担当守备京师之重任，请求陛下重塑武备，整顿京营。常年不上朝的崇祯帝朱由检在收到上书后深受触动，感叹武勋们恭忠体国，遂召集内阁大臣于皇极殿议京营改革事。内阁众臣对于武勋们改革京营的提案给予了充分的肯定和支持。

消息传到朝中，众臣纷纷，对于京营的情况，朝臣们心里门清的很，对于改革京营鼎力支持的同时，纷纷请奏，攻讦武勋集团。

御史梁清标上书言：如今京营之乱象，兵源上无兵可用——“皆诡寄靡饷，无一人可用，盖甲鬻于乙，乙鬻于丙，更易不知凡几”相互顶替托名，若有战，根本无人可实际参战。有的士兵竟然可以追溯到嘉靖隆庆时代，简直明代版冥府神兵！而从军的实际人员呢？“非市井游手，即势宦苍头，从无纪律”。军队成分非常差，根本无法维持正常军事训练活动。武官作为军队的直接统帅，经常克扣各种名目的军费军饷，以至于“支粮则有，调遣则无”。也就是说，军饷会按照规定发放，但是实际却没有这个人，军饷落入将领私囊。更有甚者，名将郭英之后郭勋竟然将骑兵战马草场租借出去以获利润，使得部队战马无从补给。x33

而实际在营的部队，也时常领不到军饷，因为“口食不给”、“以相保寝食而已”，士兵素质极为低下，往往面有菜色、不能穿戴甲胄，骑兵也“上马亦不能挥鞭而驽马”。

概言如今京营已是积重难返，京营改革势在必行，但乱世用重典，若是继续由武勋集团人员组织改革，势必无功而返，力主由朝廷选派人员，倾力整顿，严加训练，必能使京师三大营恢复永乐大帝时的荣光。x33

因为崇祯不上朝，朝臣们纷纷以此为契机，上书抨击，攻讦，弹劾武勋集团。英国公张之极，成国公朱纯臣，定国公徐允祯，恭顺侯吴惟贤等等都成为了文官集团的攻讦对象，甚至连皇帝老丈人嘉定伯周奎都被人上书弹劾，每个人都被罗列出了罪状，只是有的人多有的人少而已。

而武勋集团收到攻讦后，也不示弱，纷纷收集，列举出朝中众臣的黑料，上书弹劾。内阁诸位大臣也在其列。

朝中两派在整个九月互撕，争斗愈演愈烈，而朱由检此一直都没有选择上朝理事，对攻讦的奏折也是一律留中不发，每每都是通过内监传递消息，而自己却是端坐钓鱼台，一边冷眼旁观，一边努力推进其核心势力名下产业的快速发展。如让巩永固控制